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管理费用是企业行政管理部门为组织和管理生产经营活动而发生的各种费用，因此，企业发生审计费用且收到对应发票，应当通过“管理费用”等相关二级科目以及“应交税费”相关二级科目、“银行存款”科目核算。企业代为承担的会计师事务所住宿费用、餐饮费用以及往来旅客运输费用，属于审计直接费用(不属于业务招待费)，也应计入管理费—审计费。在企业所得税上，企业发生的审计费用，属于与取得收入有关的支出，应当允许企业所得税税前扣除。
但对取得的增值税抵扣凭据能不能抵扣要区分情况：根据财政部 国家税务总局2019年第39公告第六条规定，纳税人购进国内旅客运输服务，其进项税额允许从销项税额中抵扣。但根据总局2019年第31号公告第一条规定，39号公告中的“国内旅客运输服务”，限于与本单位签订了劳动合同的员工，以及本单位作为用工单位接受的劳务派遣员工发生的国内旅客运输服务。所以，对所承担的其他单位人员的国内旅客运输服务进项税额不得进行抵扣。除此外，如支付审计人员住宿费等，取得了合法抵扣凭据，可以抵扣进项税。
因此,企业与审计单位签订合同时，将住宿费、餐饮费用以及往返旅客运输服务费用包含到合同价之中，一方面，企业所得税可以名正言顺进行全额税前扣除;另一方面对往返旅客运输服务费用由审计单位名正言顺进行抵扣。
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